MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 10658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011981	GCC	2	6	60249	60254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102463
1002	NC_011981	CGGC	2	8	60290	60297	0 %	0 %	50 %	50 %	222102463
1003	NC_011981	GGATGG	2	12	60310	60321	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	222102463
1004	NC_011981	TGC	2	6	60333	60338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102463
1005	NC_011981	GTC	2	6	60352	60357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102463
1006	NC_011981	TGG	2	6	60395	60400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102463
1007	NC_011981	GCTC	2	8	60500	60507	0 %	25 %	25 %	50 %	222102463
1008	NC_011981	CG	3	6	60534	60539	0 %	0 %	50 %	50 %	222102463
1009	NC_011981	GGA	2	6	60546	60551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102463
1010	NC_011981	TCG	2	6	60566	60571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102463
1011	NC_011981	TGG	2	6	60704	60709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102463
1012	NC_011981	CCGGTC	2	12	60754	60765	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222102463
1013	NC_011981	CAGGG	2	10	60794	60803	20 %	0 %	60 %	20 %	222102463
1014	NC_011981	AGA	2	6	60857	60862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102463
1015	NC_011981	AGC	2	6	60884	60889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102463
1016	NC_011981	GAT	2	6	60915	60920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102463
1017	NC_011981	CCG	2	6	60929	60934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102463
1018	NC_011981	ATGG	2	8	60953	60960	25 %	25 %	50 %	0 %	222102463
1019	NC_011981	TGC	2	6	61079	61084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102464
1020	NC_011981	TCG	2	6	61126	61131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102464
1021	NC_011981	TTA	2	6	61171	61176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102464
1022	NC_011981	GAT	2	6	61227	61232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102464
1023	NC_011981	AAC	2	6	61251	61256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102464
1024	NC_011981	TCG	2	6	61342	61347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102464
1025	NC_011981	CCAA	2	8	61425	61432	50 %	0 %	0 %	50 %	222102464
1026	NC_011981	TGC	2	6	61441	61446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102464
1027	NC_011981	GAT	2	6	61458	61463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102464
1028	NC_011981	CAT	2	6	61466	61471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102464
1029	NC_011981	TGA	2	6	61541	61546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102464
1030	NC_011981	AG	3	6	61578	61583	50 %	0 %	50 %	0 %	222102464
1031	NC_011981	GAC	2	6	61632	61637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102464
1032	NC_011981	GAA	2	6	62498	62503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102465
1033	NC_011981	AT	3	6	62572	62577	50 %	50 %	0 %	0 %	222102465
1034	NC_011981	ATG	2	6	62604	62609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102465
1035	NC_011981	GAGG	2	8	62630	62637	25 %	0 %	75 %	0 %	222102465
1036	NC_011981	TCA	2	6	62665	62670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102465
1037	NC_011981	AGC	2	6	62751	62756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102465
1038	NC_011981	GAT	2	6	62758	62763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102465
1039	NC_011981	CAAA	2	8	62839	62846	75 %	0 %	0 %	25 %	222102465
1040	NC_011981	TTGGCA	2	12	62915	62926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222102465
1041	NC_011981	AGC	2	6	63006	63011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102465
1042	NC_011981	GAT	2	6	63062	63067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102465
1043	NC_011981	GGC	3	9	63105	63113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102465
1044	NC_011981	GGC	2	6	63226	63231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102465
1045	NC_011981	GGT	2	6	63283	63288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102465
1046	NC_011981	A	8	8	63324	63331	100 %	0 %	0 %	0 %	222102465
1047	NC_011981	CTA	2	6	63563	63568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102466
1048	NC_011981	ACG	2	6	63611	63616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1049	NC_011981	ATG	2	6	63623	63628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102466
1050	NC_011981	CGA	2	6	63750	63755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1051	NC_011981	ATC	2	6	63767	63772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102466
1052	NC_011981	TG	3	6	63779	63784	0 %	50 %	50 %	0 %	222102466
1053	NC_011981	CCG	2	6	63827	63832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102466
1054	NC_011981	TGC	2	6	63860	63865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1055	NC_011981	GGT	2	6	63887	63892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102466
1056	NC_011981	GCA	2	6	63932	63937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1057	NC_011981	CACT	2	8	64005	64012	25 %	25 %	0 %	50 %	222102466
1058	NC_011981	GCA	2	6	64077	64082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1059	NC_011981	TACA	2	8	64157	64164	50 %	25 %	0 %	25 %	222102466
1060	NC_011981	TGC	2	6	64168	64173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1061	NC_011981	AAC	2	6	64183	64188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102466
1062	NC_011981	T	6	6	64226	64231	0 %	100 %	0 %	0 %	222102466
1063	NC_011981	TCC	2	6	64236	64241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102466
1064	NC_011981	TGC	2	6	64291	64296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102466
1065	NC_011981	TC	3	6	64327	64332	0 %	50 %	0 %	50 %	222102466
1066	NC_011981	TTC	2	6	65233	65238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102467
1067	NC_011981	AGG	2	6	65298	65303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102467
1068	NC_011981	GC	3	6	65538	65543	0 %	0 %	50 %	50 %	222102468
1069	NC_011981	TGG	2	6	65590	65595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102468
1070	NC_011981	CGTGG	2	10	65606	65615	0 %	20 %	60 %	20 %	222102468
1071	NC_011981	ATGG	2	8	65643	65650	25 %	25 %	50 %	0 %	222102468
1072	NC_011981	ATG	2	6	65692	65697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102468
1073	NC_011981	CGT	2	6	65707	65712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102468
1074	NC_011981	TG	3	6	65753	65758	0 %	50 %	50 %	0 %	222102468
1075	NC_011981	ATG	2	6	65779	65784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102468
1076	NC_011981	ATC	3	9	65821	65829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102468
1077	NC_011981	GGC	2	6	65880	65885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102468
1078	NC_011981	GGC	2	6	65897	65902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102468
1079	NC_011981	CTT	2	6	65961	65966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102468
1080	NC_011981	GCC	2	6	65967	65972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102468
1081	NC_011981	GAC	2	6	65982	65987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102468
1082	NC_011981	CGC	2	6	66028	66033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102468
1083	NC_011981	GCG	2	6	66051	66056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102468
1084	NC_011981	AAT	2	6	66099	66104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102468
1085	NC_011981	CG	3	6	66107	66112	0 %	0 %	50 %	50 %	222102468
1086	NC_011981	GAC	2	6	66168	66173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102468
1087	NC_011981	GGC	2	6	66203	66208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102468
1088	NC_011981	GAT	2	6	66621	66626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102469
1089	NC_011981	C	6	6	66702	66707	0 %	0 %	0 %	100 %	222102469
1090	NC_011981	AG	3	6	66715	66720	50 %	0 %	50 %	0 %	222102469
1091	NC_011981	AGC	2	6	66741	66746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102469
1092	NC_011981	GC	3	6	66772	66777	0 %	0 %	50 %	50 %	222102469
1093	NC_011981	GCT	2	6	66853	66858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102469
1094	NC_011981	GCAA	2	8	66886	66893	50 %	0 %	25 %	25 %	222102469
1095	NC_011981	CTT	2	6	67019	67024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102469
1096	NC_011981	GCGA	2	8	67093	67100	25 %	0 %	50 %	25 %	222102469
1097	NC_011981	GAG	2	6	67239	67244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102469
1098	NC_011981	AAGA	2	8	67274	67281	75 %	0 %	25 %	0 %	222102469
1099	NC_011981	AAC	2	6	67326	67331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102469
1100	NC_011981	CGA	2	6	67357	67362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102469
1101	NC_011981	CGC	2	6	67409	67414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102469
1102	NC_011981	CA	3	6	67415	67420	50 %	0 %	0 %	50 %	222102469
1103	NC_011981	A	6	6	67445	67450	100 %	0 %	0 %	0 %	222102469
1104	NC_011981	CGG	2	6	67490	67495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102469
1105	NC_011981	GAG	2	6	67542	67547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102469
1106	NC_011981	GCG	2	6	67555	67560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102469
1107	NC_011981	ATT	2	6	67728	67733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102470
1108	NC_011981	GAG	2	6	67761	67766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102470
1109	NC_011981	GAA	2	6	67783	67788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102470
1110	NC_011981	CCT	2	6	67797	67802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102470
1111	NC_011981	TCA	2	6	67830	67835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102470
1112	NC_011981	AGC	2	6	67961	67966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102470
1113	NC_011981	CGC	2	6	68044	68049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102470
1114	NC_011981	CGA	2	6	68051	68056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102470
1115	NC_011981	CGCAC	2	10	68266	68275	20 %	0 %	20 %	60 %	222102470
1116	NC_011981	CGG	2	6	68310	68315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102470
1117	NC_011981	GATC	2	8	68329	68336	25 %	25 %	25 %	25 %	222102470
1118	NC_011981	CGC	3	9	68404	68412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102470
1119	NC_011981	TCA	2	6	68417	68422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102470
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1122	NC_011981	GGAG	2	8	68550	68557	25 %	0 %	75 %	0 %	222102470
1123	NC_011981	ACG	2	6	68582	68587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102470
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1251	NC_011981	AGCG	2	8	74785	74792	25 %	0 %	50 %	25 %	222102476
1252	NC_011981	CGG	2	6	74913	74918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102477
1253	NC_011981	TGA	2	6	74947	74952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102477
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1258	NC_011981	ACTC	2	8	75529	75536	25 %	25 %	0 %	50 %	222102477
1259	NC_011981	GC	3	6	75576	75581	0 %	0 %	50 %	50 %	222102477
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1351	NC_011981	T	6	6	81440	81445	0 %	100 %	0 %	0 %	222102484
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1353	NC_011981	CT	3	6	81483	81488	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
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1362	NC_011981	TAC	2	6	82050	82055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102484
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1367	NC_011981	CT	4	8	82304	82311	0 %	50 %	0 %	50 %	222102484
1368	NC_011981	CTTGCC	2	12	82391	82402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222102485
1369	NC_011981	GCA	2	6	82519	82524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102485
1370	NC_011981	GTG	2	6	82604	82609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102485
1371	NC_011981	CGG	2	6	82623	82628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
1372	NC_011981	ACCG	2	8	82650	82657	25 %	0 %	25 %	50 %	222102485
1373	NC_011981	CGC	2	6	82725	82730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102485
1374	NC_011981	TC	3	6	82792	82797	0 %	50 %	0 %	50 %	222102485
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1376	NC_011981	GGC	2	6	82820	82825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102485
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